“211工程”所需建設(shè)資金，采取國家、部門、地方和高等學(xué)校共同籌集的方式解決。按現(xiàn)行高等教育管理體制，建設(shè)資金主要由學(xué)校所屬的部門和地方政府籌措安排，中央安排一定的專項(xiàng)資金給予支持，對工程建設(shè)起推動(dòng)、指導(dǎo)和調(diào)控作用。
部門和地方政府的專項(xiàng)資金，優(yōu)先保證國家重點(diǎn)學(xué)科、高等教育公共服務(wù)體系建設(shè)的需要，并安排好有關(guān)高等學(xué)校上水平所必須的基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)。中央專項(xiàng)資金主要用于國家重點(diǎn)學(xué)科和高等教育公共服務(wù)體系的建設(shè)，補(bǔ)助少數(shù)高等學(xué)校整體水平提高所需基礎(chǔ)設(shè)施的建設(shè)。
“九五”期間，“211工程”在99所高校中實(shí)施建設(shè)，主要安排了602個(gè)重點(diǎn)學(xué)科和兩個(gè)全國高等教育公共服務(wù)體系建設(shè)項(xiàng)目。
“十五”期間，“211工程”在107所大學(xué)中實(shí)施建設(shè)，主要安排了821個(gè)重點(diǎn)學(xué)科和三個(gè)全國高等教育公共服務(wù)體系建設(shè)項(xiàng)目。
到2005年，中國共計(jì)75個(gè)學(xué)科進(jìn)入了ESI的數(shù)據(jù)庫中前1%，涉及到21所高校，而這些高校全部都是“211工程”的學(xué)校，而且主要集中在材料科學(xué)、化學(xué)、物理學(xué)、工程學(xué)和計(jì)算機(jī)學(xué)科，這些學(xué)科都是“211工程”的重點(diǎn)建設(shè)的學(xué)科。
根據(jù)ESI所提供的統(tǒng)計(jì)結(jié)果，清華大學(xué)材料學(xué)科在1995年到2005年期間發(fā)表的SCI論文總數(shù)為3677篇，排在世界大學(xué)的第二位，這個(gè)學(xué)科在世界排在第二位。
根據(jù)ESI數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果，1995到2005年的“211工程”建設(shè)十年當(dāng)中，北京大學(xué)化學(xué)學(xué)科在SCI發(fā)表的論文數(shù)是4526篇，列世界大學(xué)的第15位，論文引用數(shù)是23778位，排在世界大學(xué)的第103位。
中南大學(xué)發(fā)揮有色金屬資源與材料領(lǐng)域長期積淀的學(xué)科特色，以先進(jìn)的有色稀有金屬與粉末有金材料，有色金屬資源快速勘察與可持續(xù)發(fā)展等“211工程”建設(shè)項(xiàng)目為紐帶，然后建成了在地質(zhì)、采礦、選礦、冶金、材料、機(jī)械六大領(lǐng)域，以國家重點(diǎn)學(xué)科為支撐，完備的有色金屬材料與資源學(xué)科創(chuàng)新體系。
清華大學(xué)就面向國家發(fā)展的戰(zhàn)略需求，對信息能源、材料等學(xué)科進(jìn)行了布局調(diào)整，推進(jìn)學(xué)科群的建設(shè)。
南京大學(xué)采用學(xué)科特區(qū)的建設(shè)模式，這對某一些學(xué)科非常重要，由于高校內(nèi)部的體制不一定整體上能夠到位，可以在有局部建立一些學(xué)科布局，這吸取了中國經(jīng)濟(jì)建設(shè)像深圳特區(qū)的一些發(fā)展和經(jīng)驗(yàn)。