學校前身是1942年創(chuàng)辦于山東抗日根據(jù)地的“戰(zhàn)時郵務總局干部訓練班”，歷經(jīng)“戰(zhàn)郵”學校、山東大學郵電專科部、華東郵電學校等階段，1958年經(jīng)國務院批準改建為本科高校，取名南京郵電學院，2005年4月更名為南京郵電大學。
學校原為郵電部和信息產(chǎn)業(yè)部直屬重點高校，2000年起實行中央與地方（現(xiàn)為工業(yè)和信息化部、國家郵政局與江蘇省）共建，以江蘇省管理為主。2013年，原南京人口管理干部學院正式并入南京郵電大學。2018年成為教育部與江蘇省共建的“雙一流”建設高校。