南京中醫(yī)藥大學始建于1954年，是中國建校最早的高等中醫(yī)藥院校之一，是教育部和江蘇省共建的國家“世界一流學科建設高校”，是江蘇省人民政府與國家中醫(yī)藥管理局共建高校、江蘇省重點建設高校、江蘇省高水平大學建設高校。
南京中醫(yī)藥大學是世界一流中醫(yī)藥大學建設聯(lián)盟、長三角醫(yī)學教育聯(lián)盟創(chuàng)始成員，是世界衛(wèi)生組織（WHO）傳統(tǒng)醫(yī)學合作中心、國家衛(wèi)生部確定的國際針灸培訓中心、全國首批博士和碩士學位授權單位、全國古籍重點保護單位、全國中醫(yī)師資進修教育基地、國家建設高水平大學公派研究生項目實施高校、國家“特色重點學科項目”建設高校、國家“卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃”改革首批試點高校、國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)、中國政府獎學金來華留學生接收院校。